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これらは腸外症状（EIM）として知られ、しばしば活動性疾患の間に起こるが、腸疾患の徴候の前または寛解の時期に発症することがある. ジョイント 関節炎としてよく知られている関節の炎症は、IBDの一般的な合併症である. Crohn s Colitis（結腸内のCrohn病）で最も一般的であり、UC患者10人中1人にも影響を及ぼします. 炎症は、通常、肘、手首、膝および足首を含む腕および脚の大きな関節に影響を及ぼす. 関節腔に液体が集まり、痛みを伴う腫れが起こりますが、痛みは明らかに腫脹することなく起こります. これは、IBDが寛解している場合でさえ、より持続性があり、持続する可能性がある. 時には、脊柱および骨盤の関節に強直性脊椎炎（またはそれほど重症のない形態の仙腸炎）と呼ばれる状態に炎症を起こすことがあり、. 薬物および理学療法は、これらの症状の治療に役立ち、その状態は、通常、リウマチ学者および消化器専門医によって共同で管理される. 最も一般的な皮膚の問題は、結節性紅斑であり、IBDの7人に1人が罹患し、男性よりも女性においてより一般的である. IBDに関連する別の皮膚状態はSweet s症候群であり、柔らかい赤色小結節が上肢、顔面および頸部に現れ、時には発熱. これらは、皮膚のどこにでも起こり得るが、最も一般的には、脛またはストーマの近くに現れる. この状態は時々ありますが、必ずしもIBDのフレアアップにリンクされるとは限りません. それはしばしば局所療法を伴う皮膚科医によって治療されるが、ステロイド、免疫抑制剤または生物学的療法による薬物治療が必要な場合がある. これらの傷は軽度で数週間で消えることがありますが、時には数週間続くことがあり、ステロイド治療が必要な場合もあります. 最も一般的な状態は上咽頭炎であり、強膜を覆う組織の層に影響を与え、白い外皮が目に見え、赤く、痛く、炎症を起こす.

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上咽頭炎はIBDと同時に発生する傾向があり、通常は冷たい圧迫で治療することができる。ときどきステロイド滴が処方される. IBDに関連する他の2つの眼の状態は、強膜炎（強膜の炎症自体）およびブドウ膜炎（虹彩の炎症）であり、. あなたが目の刺激、発赤または炎症のいずれかの種類を取得した場合は、常にそれをあなたの医者に言及してください。. 強膜炎およびブドウ膜炎は、通常、免疫抑制剤または生物学的薬剤が必要とされるが、ステロイド滴で治療することができる. 骨の損失は、炎症過程自体、骨形成に必要なカルシウムの乏しい吸収、乳製品を避けることによる低カルシウムレベル、またはステロイド投薬または喫煙の使用によるものであり得る. これは、二重エネルギーX線吸光光度法（DEXA）スキャンによって診断することができる. 骨の薄化は、炎症過程そのもの、骨形成に必要なカルシウムの吸収不良、低カルシウムレベル、酪農食品、喫煙、身体活動の低下、またはステロイド薬の使用が原因である可能性があります. カルシウムとビタミンDのサプリメント、禁煙、体重を支える身体活動、ステロイドの回避、そして一部の人々にとっては、薬物治療が役立ちます. これは小腸の炎症が原因で脂肪吸収不良を引き起こすため、脂肪はカルシウムに結合し、シュウ酸塩と呼ばれる分子は自由に吸収され、腎臓に沈着して石を形成することができます. 小腸の炎症は尿管（尿を腎臓から膀胱まで運ぶ管）に影響を及ぼし、管を押して閉塞させ、排尿を防ぐ. これは腎臓を腫脹させ、尿が再び流れるように組織の炎症部分を除去するために手術が必要になることがあります.

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これらはコレステロールで作られた小さな石で、胆のうの中で肝臓のすぐ下に閉じ込められ、非常に苦痛を伴うことがあります. クローン病と関連したいくつかの要因は、胆石の消化を助長する小腸の端部の除去またはこの領域における重度の炎症を（腸内の脂肪を消化するのに役立つ）. IBD（例えば、アザチオプリンおよびメトトレキセート）を治療するために使用される薬物のいくつかは、肝臓に影響を及ぼし得る. 原発性硬化性胆管炎（Primary Sclerosing Cholangitis、PSC）は、CD 50例中1例およびUC患者13例中1例に発症するまれな疾患です. 治療は通常肝臓移植であり、ウルソデオキシコール酸と呼ばれる薬剤も使用することができる. 血液循環 IBD患者は、脚にDVT（深部静脈血栓症）、肺に肺塞栓症を含む血栓を発症する可能性が2倍以上ある. あなたは特にフレアアップの際に危険にさらされているかもしれません。また、病院などでベッドに閉じ込められている場合もあります. あなたの脚に痛み、腫れ、圧痛、胸痛や息切れがある場合は、すぐに医師に相談してください. あなたは、喫煙を避け、できるだけ可動性を保ち、多量の水分を飲み、サポートストッキングを着用することで、リスクを減らすことができます. このような予防措置は、航空機を使用して旅行する場合に特に役立ちます。これは、誰もが血栓のリスクを高める. あなたが貧血であれば、血液中のヘモグロビンの正常および/または低レベルよりも赤血球の数が少ないことを意味します（ヘモグロビンは赤血球に含まれるタンパク質で体内の酸素を運びます）. これは、食事中の鉄分の欠乏、食物からの鉄の吸収不良、または進行中の失血によって引き起こされる可能性があります.

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腸からの血液損失は、一般に、失血が見えなくてもクローン病患者で貧血を引き起こす. もう1つのタイプの貧血は、ビタミンB12や葉酸などの特定のビタミンの摂取量の少なさや吸収が悪いために引き起こされるビタミン欠乏性貧血です. IBD（例えば、スルファサラジンおよびアザチオプリン）に使用される薬物のいくつかはまた、貧血を引き起こし得る. 鉄欠乏性貧血の場合は、錠剤またはIV（静脈内）鉄としての鉄サプリメントを注射するか、または点滴によって注入する. IBD患者の中には、口から鉄を容認することができないことが判明しているので、より効果的なIV鉄が与えられています.